الحاضن الطبيعي لفيروس نيباه هي خفافيش الفاكهة وتنتقل العدوى منها للخنازير التي تنشر العدوى للبشر المخالطين لها عن طريق الملامسة المباشرة. و يمكن ان ينتقل الفيروس للبشر نتيجة لاستهلاك المنتجات الغذائية الملوثة بإفرازات الخفافيش والخنازير المصابة.
تكون الوقاية من الإصابة بفيروس نيباه بتجنب الخنازير المصابة وتجنب استهلاك المنتجات الغذائية الملوثة بإفرازات الخفافيش والخنازير المصابة فقط في المناطق المنتشر فيها الفيروس.
