وتعد الجمارك من أهم الدوائر التي توليها حكومة دبي الاهتمام الكبير، حيث يمتد تاريخها لأكثر من مائة عام، وكان الشيخ راشد بن سعيد آل مكتوم، حاكم دبي يستخدم الطابق الأول من المبنى مكتباً رسميا له.
ولكونها من أكبر المؤسسات المساهمة بالحياة الاقتصادية في الإمارة، استمر المسؤولون في خلق عمليات التطوير في مراجعة شاملة للدائرة، من تقييم لإستراتيجيتها وعمل خطة تطويرية تنسجم مع رؤية دبي وتطلعاتها، والتوسعات المستقبلية، وتم خلال ذلك تبني برنامج «التطوير والتحديث» تحقيقاً لرؤية جمارك دبي وتحقيق أهدافها العامة، التي من ضمنها «الجمارك الرائدة في العالم».