وتتبع كل ادارة مساعدة عدة إدارات وأقسام تختلف باختلاف مهامها، كما يتبع مدير الشؤون الصحية بالمنطقة والمحافظة عدة إدارات تشمل: ادارة الشؤون القانونية، وادارة تقنية المعلومات والاتصالات، ومركز الاحالات الطبية، وادارة المتابعة، ومكتب ادارة المشاريع، ومكتب الابداع، وادارة مكافحة عدوى المنشآت الصحية، والهيئة الصحية الشرعية، وادارة التواصل والعلاقات، وادارة الالتزام، وادارة المراجعة الداخلية، وادارة تنمية الاستثمار الصحي الخاص، ومركز الأعمال، وادارة شراء الخدمة. ويتسم الهيكل التنظيمي الجديد حال اقراره بكثرة الادارات، وتغلب عليه المركزية، كما اظهرت بيانات الهيكل عدم وجود المرونة اللازمة للمديريات والتوجه نحو خصخصة الخدمات الصحية.
أظهرت ورقة عمل أعدها فريق التحول في الوزارة ارتفاع عدد الإدارات والأقسام في المديريات من حوالي ٥٠ قسمًا وإدارة إلى ٧٨ إدارة وقسمًا
يتسم الهيكل التنظيمي الجديد بكثرة الإدارات وتغلب عليه المركزية
