وتولى سكالوني مهام المدير الفني للمنتخب في أغسطس 2018 بعد رحيل خورخي سامباولي عن المنصب إثر خروج المنتخب الأرجنتيني من دور الستة عشر بكأس العالم 2018 في روسيا، بالهزيمة أمام نظيره الفرنسي الذي واصل المشوار حتى توج باللقب.
وودع المنتخب الأرجنتيني بطولة كوبا أمريكا 2019 في الدور قبل النهائي إثر تلقيه هزيمه بثنائية نظيفة أمام المنتخب البرازيلي، صاحب الأرض، مما أثار الشكوك والتكهنات حول مستقبل سكالوني مع الفريق.
