ينظم متحف المخطوطات بمكتبة الإسكندرية بالتعاون مع وحدة برامج ذوي الاحتياجات الخاصة بالمكتبة، برنامجًا شهريًا يضم ورش عمل تثقيفية تفاعلية لذوى الاحتياجات الخاصة من جميع الأعمار، والتي تأتي تحت عنوان «رحلة داخل مخطوط»؛ وذلك بهدف تعريفهم على التراث العربي والإسلامي وتعريفهم بالذخائر التراثية ونوادر الكتب والمخطوطات بطريقة مبسطة. تتناول ورش العمل مجموعة من المحاضرات للتعريف ببعض المعروضات الموجودة داخل قاعة عرض متحف المخطوطات، ونماذج من الكتابات المتعددة وكذلك التعرف على أدوات كتابة المخطوط العربي وصناعة الورق، وأشكال اللغة العربية وتطورها، وكيفية تزيين وتذهيب المخطوطات، والأشكال الهندسية التي استخدمت في المخطوط العربي.